При получении данной субсидии денежные средства переходят в собственность организации и распределяются на расходы для осуществления деятельности. Организация вправе их направить и на выплату заработной платы. Так как сумма, направленная на выплату зарплаты, не будет обладать особым статусом, соответственно, на сумму заработной платы необходимо начислить страховые взносы и удержать НДФЛ при выплате.

Необходимо учесть, что полученная субсидия не учитывается ни в доходах, ни в расходах в целях налога на прибыль (пп. 60 п. 1 ст. 251, п. 48.26 ст. 270 НК РФ).

Доходы в виде субсидий, указанных в пп. 60 п. 1 ст. 251 НК РФ, не подлежат обложению НДФЛ (п. 82 ст. 217 НК РФ).